Автор Тема: Синтезирован циклический полипорфирин  (Прочитано 2654 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Химики синтезировали циклический полипорфирин с 24 звеньями
Британские химики с помощью темплатного синтеза получили полипорфириновый циклический олигомер, состоящий из 24 порфириновых звеньев и одной бутадииновой связки. Ученые изучили способность полученного вещества поглощать излучение и флуоресцировать, а еще посмотрели на его молекулы под микроскопом.

Структура циклического порфиринового комплекса с двумя лигандами до вытеснения цинка © Harry L. Anderson et al. / Nature Chemistry, 2022Структура циклического порфиринового комплекса с двумя лигандами до вытеснения цинка
© Harry L. Anderson et al. / Nature Chemistry, 2022

Порфиринами называют циклические производные пиррола, в которых несколько пиррольных колец соединены атомами углерода в цикл. Порфириновые фрагменты часто встречаются в живых организмах. Например, в белке гемоглобине часть активных центров представляют собой порфириновые кольца с координированными ионами железа. А еще на основе порфирина построены молекулы хлорофилла, но в его случае внутри порфирина находится ион магния.

С помощью молекул хлорофилла фотосинтезирующие организмы поглощают и преобразуют энергию солнечного света, которую потом используют в своих целях. Причем эти «антенны», которыми организмы поглощают солнечный свет, могут быть построены совершенно по-разному. Например, это могут быть вытянутые цепочки из молекул хлорофилла, между которыми встроены фрагменты белков. А иногда молекулы хлорофилла расположены по кругу в несколько слоев. И чтобы изучать то, как живые организмы поглощают энергию света, химики синтезируют порфириновые цепочки, похожие на те, которые используют фотосинтезирующие организмы.

Этим занялись и химики под руководством Гарри Андерсона (Harry L. Anderson) из Оксфордского университета. Они решили синтезировать циклический олигомер наподобие того, какой встречается у фотосинтезирующих пурпурных бактерий.
Ученые начали с компьютерного моделирования – они хотели выяснить, какого размера кольцо будет достаточно устойчиво, чтобы его можно было синтезировать. Они выяснили, что кольца небольшого размера совсем неустойчивы – химические связи в них имеют слишком нехарактерную геометрию. Напротив, большие кольца с 24 порфириновыми фрагментами по расчету оказались вполне устойчивы, и химики принялись за их получение.

Чтобы провести циклизацию такой большой порфириновой цепочки, химикам нужно было найти подходящий лиганд. Он мог бы координироваться к ионам металла внутри порфириновых колец и «стягивать» концы порфириновой цепочки друг к другу. Это привело бы к более легкой циклизации.

Чтобы этот план осуществить, химики получили два связанных порфириновых кольца, в центре которых находились ионы цинка. Затем химики взяли лиганд на основе пиридина, способный двумя атомами азота координировать ионы цинка. Они измерили константу связывания этого лиганда с цинковым комплексом, и она оказалась очень большой – около 106 литров на моль. Поэтому лиганд для макроциклизации ученые решили взять тоже пиридиновый – уж очень он хорошо связывался и подходил по геометрии.

Затем, чтобы найти лучший вариант, химики промоделировали взаимодействие нескольких лигандов с порфириновой цепочкой на компьютере. Наиболее подходящий по расчету лиганд состоял из 12 пиридиновых колец, связанных длинными цепочками углеродов и бензольных колец с центральным бензольным кольцом. Причем из-за того, что порфириновая цепочка состояла из 24 звеньев, для координации всех ионов цинка и успешного «стягивания» таких лигандов требовалось две штуки.

Далее химики попробовали провести темплатный синтез порфиринового олигомера. Они взяли порфириновую цепочку из 24 звеньев, добавили к ней два эквивалента лиганда, а затем медный и палладиевый катализаторы. В результате два конца цепочки объединились бутадииновой связкой, и циклический комплекс успешно получился. Затем ионы цинка вытеснили из него избытком пиридина — в результате получился порфириновый олигомер. За счет того что целевая молекула оказалась очень большой с внутренним диаметром около 7 нанометров, химикам удалось посмотреть на нее в сканирующий туннельный микроскоп.

В результате химики получили порфириновый олигомер из 24 звеньев. Исследование его флуоресцентных свойств показало, что он способен принимать и передавать на бутадииновый фрагмент до 30 процентов полученной энергии света.
https://ареолаб.рф/news/Химики-синтезировали-циклический-полипорфирин-с-24-звеньями

Онлайн djsvarnoiy

  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 12 819
  • Репутация: +102/-17
  • Пол: Мужской
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #1 : Январь 15, 2023, 19:12 »
 :shocked:

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #2 : Январь 15, 2023, 19:32 »
он способен принимать и передавать на бутадииновый фрагмент до 30 процентов полученной энергии света.
А вот это уже интересно. Ибо именно спиральному ходу энергии в потоке света и образуюется молекула жизни ДНК.

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #3 : Январь 15, 2023, 22:49 »
А вот это уже интересно. Ибо именно спиральному ходу энергии в потоке света и образуюется молекула жизни ДНК.
ДНК и СВЕТ вообще никак не связаны!
Энергия в молекулах передается  по  сопряженным двойным связям,  связывающих различные части молекулы. Нуклеотиды связаны между собой через моносахарид дезоксирибозу и фосфорную кислоту, т.е не  сопряжены между собой

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #4 : Январь 15, 2023, 22:52 »
ДНК и СВЕТ вообще никак не связаны!
Энергия в молекулах передается  по  сопряженным двойным связям,  связывающих различные части молекулы. Нуклеотиды связаны между собой через моносахарид дезоксирибозу и фосфорную кислоту, т.е не  сопряжены между собой
Я говорю о связи структуры потоков энергии со структурой растущих из них молекул жизни.

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #5 : Январь 15, 2023, 22:53 »
Разве выше не говорится, что эти белки поглощают энергию света и отдают назад лишь 30% ?

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #6 : Январь 16, 2023, 00:22 »
Это не белок , это циклический полипорфирин, молекула сопряженная.
Центральная часть   координационно связана с внешней, порфириновой частью
Исходный порфирин цинка - флуоресцентный краситель.

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #7 : Январь 16, 2023, 08:34 »
Это не белок , это циклический полипорфирин, молекула сопряженная.
Центральная часть   координационно связана с внешней, порфириновой частью
Исходный порфирин цинка - флуоресцентный краситель.
Ну, так тогда модель протобелка, весьма неплохой новый инструмент для изучения указанного преобразования световой энергии в протобелковые формы вещества.

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #8 : Январь 16, 2023, 23:06 »
Ну, так тогда модель протобелка, весьма неплохой новый инструмент для изучения указанного преобразования световой энергии в протобелковые формы вещества.
Модель интересная, но к белкам она не имеет НИКАКОГО отношения!

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #9 : Январь 17, 2023, 05:16 »
Модель интересная, но к белкам она не имеет НИКАКОГО отношения!
А где основания для такого отрицания? Исследовали на белках?

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #10 : Январь 17, 2023, 23:18 »
А где основания для такого отрицания? Исследовали на белках?
ВЫ  структуру видите?  Нет там аминокислот! А аминокислоты -главный признак белков.
Вещество только получено одной единственной группой ученых. Скорее всего в миллиграммовых количествах
Вряд ли его можно получить кому-то у них для собственных исследований

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #11 : Январь 18, 2023, 01:15 »
ВЫ  структуру видите?  Нет там аминокислот! А аминокислоты -главный признак белков.
Аминокислоты, как оказалось - лишь одна из форм белковых молекул. Никитин из МФТИ на-днях доложил о жизнедеятельности  и других видов соединений ДНК-молекул и белков.
https://news.mail.ru/society/54688605/

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #12 : Январь 18, 2023, 23:10 »
Аминокислоты, как оказалось - лишь одна из форм белковых молекул. Никитин из МФТИ на-днях доложил о жизнедеятельности  и других видов соединений ДНК-молекул и белков.
https://news.mail.ru/society/54688605/
Аминокислоты - это минимальные структурные фрагменты белков. Все белки состоят из 20 аминокислот, их кодируют 4 нуклеотида из которых состоят ДНК и РНК.
Учите матчасть, вы не знаете самой элементарщины

Оффлайн Дмитрий Мотовилов

  • Доктор наук РАЕ
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 11 224
  • Репутация: +59/-30
  • Пол: Мужской
  • Наука и философия Мотовилова
    • E-mail
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #13 : Январь 19, 2023, 02:29 »
Аминокислоты - это минимальные структурные фрагменты белков.
Так я вам о том и толкую.

Оффлайн Arkadiy

  • Moderator
  • Эксперт
  • *****
  • Сообщений: 26 516
  • Репутация: +148/-61
  • Пол: Мужской
  • к.т.н. (органическая химия) Профессор РАЕ
Re: Синтезирован циклический полипорфирин
« Ответ #14 : Январь 21, 2023, 21:51 »
Так я вам о том и толкую.
В данной структуре НЕТ остатков аминокислот!